达尔文相信所有的物种都是由简单的生命单位演变而来，但最初的生命是怎么来的呢?一个不常被人提及的事实是达尔文认为它们是被创造的 。在第380页，有这样的一个结论，
"Therefore I should infer from analogy that probably all the organic beings which have ever lived on this earth have descended from some one primordial form,into which life was first breathed."
这里大概的意思就是，他在经过类比以后得出结论，所有在地球上的有机生物都是起源于一个共同的原始生命，而这个原始生命则是"被吹了一口气"(breathed)而来的 。
这与圣经里创世记里讲到人是因上帝吹了一口气而得到生命的写法有点相似 。
在该书的最后一句话，也可以说是大结局，同样的主题再次地出现，在第384页我们可以看到，
"There is grandeur in this view of life,with its several powers,having been originally breathed into a few forms or into one;and that,whilst this planet has gone cycling on according to the fixed law of gravity,from so simple a beginning endless forms most beautiful and most wonderful have been,and are being,evolved."
大致的意思就是，该书所持的生命观是十分宏伟的，在巨大的能力之下，最初的生命被创造(breathed)成一个或几个种类，然后就在自然规律的管辖之下，美丽的生物世界就在循环往复的无尽進化过程中形成了，这种進化仍在進行着 。
这里描述最初生命的来源的时候用了同样的一个字，根据第411页的注释，在第二版中，达尔文在"breathed"之后更是加上了"by the Creator"，清楚地说明了他相信有那么一位创造者，是所有生命的起源 。
所以，進化论否定了圣经和上帝吗?我相信至少达尔文不是这样认为的，其他这样认为的人又是根据什么呢?如果我们因接受了片面的教育而失去了与上帝的关系，及随之而来的生活中的喜乐，岂不是太可惜了吗?
相信上帝违背科学和理性吗?
达尔文得出了上帝是生命起源的结论，这是发自内心的信仰，还是一个不得已的结论，我们不得而知 。我们常听说诸如"相信上帝是不科学的"或"科学已经否定了上帝"之类的话，但这些话本身不一定就是科学的，至少是值得我们進一步商酌的 。正如达尔文一样，我们会思索、探讨最初的起源的问题，但如果不承认有上帝的话，将会遇到一个很大的难题，人们往往会不得不以很不科学的方法来解决 。
就拿宇宙和生命的存在为例，如果不相信上帝的创造，我们只有两种选择，一个是宇宙万物是永恒的，没有开始也没有结束，没有所谓的创造及起源一说;另一种选择就是宇宙万物是自己来的，也就是说是自己创造了自己 。
我们先分析一下第一种选择，宇宙是永恒的说法，与其说这是一种可靠的理论，还不如说是一个人不愿意相信上帝的借口，因为它是与现有的最新科学证据背道而驰的 。现今的科学不但是在研究宇宙的开始，还在探讨宇宙的终结 。另外，根据我们的日常观察，宇宙的组成部分，如地球和太阳等等，都是有寿命的，这些有限的东西累加起来，整么又可以成为永恒呢?所以这种说法与我们的理性也是相矛盾的 。当然，宇宙是如此的浩大，有许多东西我们并不十分清楚，但至少从我们现有的知识和证据来看，宇宙万物不是永恒的 。一个本着科学态度的人，应该承认这一点 。
让我们再来看一下宇宙自己创造了自己的说法 。根据我们的日常观察，大凡有功用的东西，小到一双筷子，大到一台超级电脑，都一定有其设计，是被创造的，它们不可能自己创造了自己 。我们看到一台机器，尽管我们不一定知道是谁造的，但一定会想到是被造的 。如果有人认为它不是被创造的，我们一定会说此人不理性 。但一个单细胞就比任何的机器的运作复杂且精密的多，整个宇宙的运行和其上的规律更是不可同光年而语 。有谁会相信随便堆起来的字符可以成为经典名著呢?又有谁会相信自己手头上的工作会自己做成呢?连这些小事都不可以，我们又凭什么认定宇宙一定没有创造者呢?这是一个符合理性的结论吗?
在解释万物及生命起源的时候，所有的理论都是要靠信心来接受的，也既是说，都是信仰 。要接受不相信上帝的信仰，应该是需要更大的信心，需要克服更大的障碍，因为这些信仰里实在是包含了太多的未知因素 。这也许是为什么许多现代科学的奠基人，诸如牛顿、伽利略、麦实维尔、法拉第、爱因斯坦、爱迪生、及达尔文等等，都相信上帝的原因 。
每个人都有不相信上帝的自由，但要用科学和理性来作为根据可能是有点说不过去 。
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