当在网上购物时，用户面临的一个很大的问题就是如何在众多的网站找到自己想要的物品，并以最低的价格买到 。搜索引擎看起来很简单：用户输入一个查询关键词，搜索引擎就按照关键词到数据库去查找，并返回最合适的Web页链接 。这主要不是由于技术原因，而是由于在线商家希望保护商品价格的隐私权 。因此当用户在网上购物时，不得不一个网站一个网站搜寻下去，直到找到满意价格的物品 。
3、交易的安全性得不到保障
电子商务的安全问题仍然是影响电子商务发展的主要因素 。由于Internet的迅速流行，电子商务引起了广泛的注意，被公认为是未来IT业最有潜力的新的增长点 。然而，在开放的网络上处理交易，如何保证传输数据的安全成为电子商务能否普及的最重要的因素之一 。调查公司曾对电子商务的应用前景进行过在线调查，当问到为什么不愿意在线购物时，绝大多数的人的问题是担心遭到黑客的侵袭而导致信用卡信息丢失 。因此，有一部分人或企业因担心安全问题而不愿使用电子商务，安全成为电子商务发展中最大的障碍 。
电子商务的安全问题其实也是人与人之间的诚信问题，和现实商业贸易相识，均需双方的共同协作和努力 。电子商务的未来，需要所有网民的共同协作 。
4、电子商务的管理还不够规范
电子商务的多姿多彩给世界带来全新的商务规则和方式，这更加要求在管理上要做到规范，这个管理的概念应该涵盖商务管理、技术管理、服务管理等多方面，因此要同时在这些方面达到一个比较令人满意的规范程度，不是一时半时就可以做到的 。另外电子商务平台的前后端相一致也是非常重要的 。前台的Web平台是直接面向消费者的，是电子商务的门面 。而后台的内部经营管理体系则是完成电子商务的必备条件，它关系到前台所承接的业务最终能不能得到很好的实现 。一个完善的后台系统更能体现一个电子商务公司的综合实力，因为它将最终决定提供给用户的是什么样的服务，决定电子商务的管理是不是有效，决定电子商务公司最终能不能实现赢利 。
5、税务问题
税务（包括关税和税收）是一个国家重要的财政来源 。由于电子商务的交易活动是在没有固定场所的国际信息网络环境下进行，造成国家难以控制和收取电子商务的税金 。
6、标准问题
各国的国情不同，电子商务的交易方式和手段当然也存在某些差异，而且我们要面对无国界、全球性的贸易活动，因此需要在电子商务交易活动中建立相关的、统一的国际性标准，以解决电子商务活动的互操作问题 。搞商务的搞电子，呈现一种离散、无序、局部的状态 。
7、配送问题
配送是让商家和消费者都很伤脑筋的问题 。网上消费者经常遇到交货延迟的现象，而且配送的费用很高 。业内人士指出，中国国内缺乏系统化、专业化、全国性的货物配送企业，配送销售组织没有形成一套高效、完备的配送管理系统，这毫无疑问地影响了人们的购物热情 。
8、知识产权问题
在由电子商务引起的法律问题中，保护知识产权问题又首当其冲 。由于计算机网络上承载的是数字化形式的信息，因而在知识产权领域（专利、商标、版权和商业秘密等）中，版权保护的问题尤为突出 。
9、电子合同的法律问题
在电子商务中，传统商务交易中所采取的书面合同已经不适用了 。一方面，电子合同存在容易编造、难以证明其真实性和有效性的问题；另一方面，现有的法律尚未对电子合同的数字化印章和签名的法律效力进行规范 。
10、电子证据的认定
信息网络中的信息具有不稳定性或易变性，这就造成了信息网络发生侵权行为时，锁定侵权证据或者获取侵权证据难度极大，对解决侵权纠纷带来了较大的障碍 。如何保证在网络环境下信息的稳定性、真实性和有效性，是有效解决电子商务中侵权纠纷的重要因素 。
11、其他细节问题
最后就是一些不规范的细节问题，网上商店服务的地域差异大；在线购物发票问题大；网上商店对定单回应速度参差不齐；电子商务方面的法律，对参与交易的各方面的权利和义务还没有进行明确细致的规定 。
垂直电商（Vertical market）是指在某一个行业或细分市场深化运营的电子商务模式 。
对于垂直电商，即使有大量用户，但要达到全国建仓库的区域销售规模还是很难，这直接导致配送成本居高不下、送货速度难以提升 。
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