随后，新西兰初级产业部经过检测证明此次肉毒杆菌污染是一次乌龙事件，但据媒体报道，当时雅培和多美滋两大洋奶粉品牌在产品召回和销毁方面损失超过1亿元 。
2016年4月，雅培遭遇奶粉造假事件 。最高检官网信息显示，2015年9月，上海公安部门依法查处了一起跨全国多省市的假冒品牌婴儿奶粉案 。犯罪嫌疑人通过仿制假冒品牌奶粉罐和商标标识，购买低档、廉价或非婴幼儿奶粉，在非法加工点销售 。共制售假奶粉1.7万余罐，非法获利近200万元 。2016年4月4日，原上海美国食品药品监督管理局在官网称此案为“制售假雅培奶粉案” 。
中国奶粉行业面临挑战 。
尽管受到一系列外部干扰，但真正困扰雅培的是其在华婴幼儿奶粉业务的持续低迷 。
财报显示，2017年，由于新兴市场的挑战，雅培海外儿童营养业务的销售额下降，但被中国和印度市场的增长部分抵消 。2018年，得益于亚洲和拉丁美洲市场的增长，雅培海外儿童营养业务销售额增长 。然而，从2019年开始，雅培在中国的奶粉业务问题被曝光 。
2020年，雅培年销售额达346.08亿美元，同比增长近10% 。剔除汇率影响，海外市场儿童营养业务销售额下降约4.1% 。
雅培在其2020年财报中表示，在过去三年中，雅培的全球营养产品业务受到了许多新产品的积极影响，包括母乳低聚糖(HMO)和高蛋白产品 。在相关产品的推动下，雅培儿童营养业务在2020年和2019年分别增长了0.3%和3.4%(剔除外汇影响)，但美国、亚洲和拉丁美洲许多市场的增长被来自大中华区的挑战部分抵消 。
2021年第一季度，雅培全球营养品销售额增长6.9%，有机增长6.4% 。其中儿童营养业务增长受到不利影响，销售额同比下降2.1%，海外市场销售额同比下降2.3% 。雅培解释说，这主要是由于2020年第一季度，消费者因疫情提前增加了购买量(进而导致比较基数较高) 。
宋亮认为，雅培在中国的业绩下滑，除了新生儿出生率下降、市场竞争激烈、国产奶粉崛起以及之前的肉毒杆菌乌龙事件、奶粉造假事件外，最大的问题在于错过了三四级市场的下沉机会 。
据宋亮介绍，与惠氏、美赞臣等外资品牌不同，雅培主要是委托“国代”在线下市场做，而不是公司直接与当地经销商合作 。“这个方法有问题 。‘国代’在向各地经销商推荐雅培奶粉的同时，往往会搭售其他高毛利产品 。”
这一说法得到了华中某渠道商的证实 。在他看来，如果厂家直接和当地代理商合作，可以利用资源和团队提供更好的服务，更好的品牌渗透 。交给“国代”时，利润会被“国代”拿走10%-20%，才到达区域代理 。“国代”本身就想赚钱，手中往往握有更多高毛利的产品 。雅培的品牌流量并没有真正带给零售店 。另外，“‘国代’不敢养太多团队，因为业务上不去会有风险”，这也在一定程度上削弱了产品下沉 。
渠道商表示，雅培的核心市场在北方沿海城市，广州、深圳、江浙沪，在大部分内地城市“下沉不太好”，缺乏引流方案和市场维护人员 。“其他洋品牌基本上每个月都会联系我们的采购人员，雅培几乎没有，只是偶尔会有一些采购折扣 。在我店里，雅培的奶粉是可有可无的，我们之所以买一些货，只是为了满足个别顾客的需求 。”
从其开放市场策略来看，雅培近年来似乎更专注于产品研发和创新，很少提及具体的渠道玩法 。相比之下，虽然渠道下沉是其他外资奶粉品牌的通病，但各家公司都提出了具体的应对措施 。比如惠氏在2020年6月发布新品“臻朗”，采用本土化运营，注重渠道控制 。Freeland的“母婴”奶粉系列也采取了类似的操作 。
有机奶粉市场竞争加剧 。
有知情人士向新京报采访人员透露，雅培在中国的奶粉业务近两年进行了大幅调整，逐渐摒弃了外资品牌常用的托盘商的博弈方式 。目前渠道库存水平比较健康 。以雅培景芝、小安素为代表的有机奶粉、特色食品发展迅速，但传统常规货币产品销量下滑 。“总体来看，雅培奶粉在中国市场不温不火，包括特殊医疗食品在内的营收在50亿元左右 。”
智研咨询发布的《2019年中国内外资配方奶粉市场份额及格局分析》显示，2015年雅培有机奶粉市场份额达到有机市场第一 。随着普通配方奶粉市场趋于饱和，特殊配方奶粉市场成为新蓝海 。当时，雅培在中国市场的超高端有机奶粉景芝和特殊配方奶粉占据了中国市场的半壁江山 。
然而，随着各大品牌竞相进入市场，雅培在中国的有机奶粉市场份额正在逐渐被蚕食 。2019年，伊利推出金领塞纳姆有机奶粉 。2020年3月，君乐宝推出“优萃”有机婴幼儿奶粉，试销首月订单超过1.2亿元，折扣价比雅培景芝便宜100元左右 。同年，合生元升级了有机奶粉 。2021年5月，惠氏启赋与JD.COM超市签署战略合作协议，共同推进婴幼儿配方奶粉和有机配方奶粉的运营 。
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