夏天，在湖面风平浪静的时候，人们透过清澈的水体可以看到大片大片或浅绿或深绿的形态各异的淡水海绵动物 。海绵动物生活在多岩石的湖底，有的甚至生活在1000米深处 。海绵动物是贝加尔湖鲟鱼的主要食物 。
湖中可供人类食用的鱼类大约有50种，包括鲑鱼、鲟鱼、鳟鱼和奥木尔鱼等 。鳟鱼肉质肥美，体重可达5.5千克以上 。奥木尔鱼是供人类食用的主要鱼类，其肉质鲜嫩味美 。湖中最有趣的鱼是油鱼，这种鱼只在贝加尔湖中才有 。油鱼体长不超过24厘米，没有鱼鳞，身体透明、有光泽，体内脂肪达到35％，富含维生素A，有很大的医用价值 。油鱼还是世界上为数不多的胎生鱼类，一次可生3000尾小鱼苗 。在1000多米湖底深处，在巨大水体的压力下，即使是大炮也不能发射炮弹，但这种小小的鱼儿却依然游动自如，晚上它们升上湖面，白天则潜入湖底 。不过，油鱼对水温相当敏感，如果水温升到10℃以上，它们就无法存活了 。
在湖区周围的针叶林区里，生活和生长着大约2600种动植物，其中70％是贝加尔湖所独有的 。在湖区的水陆相接的地方，是独特的小生境，那里的动物有的生活在陆地上，却到水里去找食物吃，有的大部分时间都呆在水里，却在岸上养育后代 。湖区的陆地动物种类异常丰富，生活在中亚、欧洲、西伯利亚和东亚的不少动物种类在这里都有发现，湖边的森林里还住着一些在其他地方已经灭绝的珍稀动物 。
在湖区附近较高的山脊上，野生哺乳动物到处可见，有山羊、雪羊、高山田鼠、旱獭，驯鹿、白尾鹿、麋鹿、驼鹿、麝、西伯利亚狍子、野猪，松鼠，有的地方还有老鼠 。夏天，在山坡上和山谷里，还能看到较大的蹄类动物和它们的猎食者，特别是棕熊 。
谜一样的“海洋动物”
在贝加尔湖里，生活着世界上唯一的淡水海豹——贝加尔海豹 。贝加尔海豹的“近亲”都生活在北极地区，它们为什么出现在亚洲大陆?为什么生活在离海洋数百公里的淡水湖中?至今仍然是谜 。
有科学家认为，海豹是在第三纪时为了寻找食物渐渐迁移到内陆地区来的 。在冰河期，极地的一块冰向南方推移，贝加尔湖海豹也随之向南推进，它们从一条河游到另一条河，有时甚至还经过了陆地 。染色体分析也证实，贝加尔湖海豹来自北极圈 。不过，贝加尔湖海豹和其他海豹还是有很大的区别 。贝加尔湖海豹，特别是雌海豹，看起来非常优雅从容；贝加尔湖海豹的皮毛与其他海豹大不相同，是银灰色的；贝加尔湖海豹比其他海豹多2升血液，这
使得它们的循环系统可以储存大量的氧，它们因此可以在水下呆70分钟，可以潜到水下300米深处 。
贝加尔海豹体长可达1.5米，体重可达120千克，寿命也很长，可活50多年 。雌海豹怀孕11个月后生子，一生可产下约20只小海豹 。冬天湖面结冰的时候，雌海豹用尖利的爪子在冰上凿洞，然后在雪洞里生下一只小海豹，偶尔是两只 。小海豹生下来是黄绿色的，两个星期后转白，最终会变成高贵的银灰色 。小海豹出生的时间多数是在冬末春初，母海豹给小海豹哺乳1个半月到2个月 。
贝加尔湖里大约有6万头海豹，主要集中在湖的北部，在那里它们的身影到处可见 。夏天，海豹分散在湖面各处 。初秋，多数海豹聚集在冰面边缘安详地晒太阳，只有少数几只警觉地抬起头观察四周 。冬天，海豹藏到冰下，它们在冰上凿出气孔 。雪堆和冰丘也是它们的藏身之地 。
贝加尔湖海豹进食的时间主要在晚上，这是因为它们最喜欢的食物——油鱼总是在天黑后聚集在湖水上层约100米深的地方，这也是海豹能够到达的深处 。在白天，油鱼都沉到湖的极深处去了 。成年海豹每天大概要吃3-4千克鱼，一头海豹在一年中要吃掉1吨多鱼，主要是油鱼 。
除了海豹，贝尔加湖里还生活着海洋龙虾的“远亲”——小龙虾 。贝尔加湖龙虾特别小，共有300多个品种 。小龙虾是湖里最主要的“清洁工” 。它们以最小的伊乐藻和微生物为食 。小龙虾仅长1.5毫米左右，但据估计，每平方米湖面上大约有300万只小龙虾!如此庞大的“清洁大军”，一天之内足以将湖水上层50米的水体“清扫”三遍!
贝加尔湖里还有一种钩虾，吞吃死鱼及不幸掉入湖里淹死的昆虫等，它们也能将所有可能污染湖水的杂物一扫而光 。这是贝加尔湖水质能保持纯净清澈的又一个原因 。
【世界上最神秘的湖泊之一,淡水储备巨大而且还生活着海洋的生物】更让人称奇的是，即使是在冬天，小龙虾也不停止“工作” 。上个世纪中叶，一位研究者将一头死去的动物搁在湖冰上，第二天再去看时，只剩下一副被吃得干干净净的骨架，干净得简直可以直接拿到博物馆里去作展品了 。
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