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加拿大阿尔伯塔大学的生物学家发明了一种环状DNA测序工具,这将为病毒、作物和癌症的研究提供更准确的数据 。
环状DNA测序示意图 。德旺·梅塔/阿尔伯塔大学
研究人员将该工具发布在互联网上,并附有在实验室和计算机中进行测序操作的分步说明,可供世界各地的同行使用 。
环状DNA常见于细菌和病毒 。最近,科学家还在人类和植物细胞核中发现了这种DNA,也被称为染色体外环状DNA(eccDNA) 。
研究负责人德旺·梅塔(Devang Mehta)表示,科学家对这种类型的DNA了解有限,现在他们发现它们在癌细胞中也很常见,这可能与癌细胞快速繁殖的能力有关 。
科学家开始调查这种DNA在癌细胞中的作用,但缺乏对其研究和测序的高效工具 。
梅塔说:“我们设计了一套新的分子生物学方法和新的生物信息学算法,最终可以获得一套完整的eccDNA信息 。我们的方法允许我们对这些分子进行完全测序,为我们和其他研究人员提供了更好的细胞研究工具 。”
梅塔特别提到这个工具可能对农业科学家很有帮助,因为很多感染农作物的病毒都有环状DNA 。
【发明的测序方法】这项研究最近发表在《自然协议》上 。
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