单细胞生物虽然个体微小，但是与人类的生活有着密切的关系 。多数单细胞生物是浮游生物的组成部分，是鱼类的天然饵料 。草履虫对污水净化有一定的作用，据统计，一只草履虫每小时大约能形成60个食物泡，每个食物泡中大约含有30个细菌，因此，一只草履虫每天大约能吞食43000个细菌 。但是单细胞生物也有对人类有害的一面，如疟原虫，痢疾类变形虫等人体内寄生虫危害人类健康;海水中的某些单细胞生物大量繁殖可能造成赤潮 。
简单地说，单细胞生物与人类的关系可以分为有利和有害两个方面，有利:鱼类饵料、净化污水等，有害:危害健康，造成赤潮等 。
科技应用：
【单细胞生物是原核生物还是真核生物，出现最早的原始单细胞是原核生物还是真核生物？】单细胞分析是分析化学、生物学和医学多学科相互渗透发展形成的跨学科前沿领域 。单细胞分析的各种方法，包括毛细管电泳、微流控芯片、多种光学显微镜(荧光显微镜、聚焦荧光显微镜、全内反射荧光显微镜、多光子荧光显微镜、荧光相关显微镜、近场扫描光学显微镜等)、扫描电化学显微镜、质谱成像、原子力显微镜、扫描隧道显微镜图像分析、阿达玛变换显微光谱及成像、肿瘤电化学及免疫分析、动力学分析、荧光及发光探针、纳米技术以及实时动态检测等新技术和新方法 。
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