首先你这个命题本身就存在问题，南京大学和北航的录取分数线差很多吗？2019年黑龙江省南京大学的理科最低录取分数线是669分，而北航是660分，只差9分 。所以题主的命题是伪命题 。
【卡分数线进南京大学和去北航最优秀的专业相比哪个更划算？】即便是伪命题，我也根据自己的理解谈谈选择学校和专业的问题 。
如果学校层次相差甚远，当然是首选学校 。如果相差不多，当然首选专业 。
现在有很多高中毕业生，只知道学习，没有爱好，不知道学什么专业，那就首选学校，反正学啥都一样 。
如果孩子有特别喜欢的专业，当然是保证专业的前提下，选择最好的学校 。
一家之言仅供参考 。
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