虽然直至1984年都至少每年有1支德甲球队入围欧洲赛事的半决赛，但都无法与其在1970年代所取得的成就相比 。
自1990年代初以来，德甲联赛的受欢迎程度日渐增长 。
一方面这是因为国家队所取得的竞赛成就（1990年第三次夺得世界杯及1996年第三次夺得欧洲杯），另一方面则是受益于德甲成为了媒体的目标市场 。
自普莱米尔电视台于1990年开始对德甲赛事进行现场直播后，德国卫星一台也在1年后接管了周六夜晚比赛的电视转播权 。
两德统一后，东德足球协会在1991年被并入德国足协 。
由于东德足球联赛系统与西德的比赛运作类似，汉莎罗斯托克和德雷斯顿迪纳摩得以从东德高级联赛进入德甲 。
因此在1991-92赛季中德甲临时扩军至20队，其中降级名额将多达4队 。
二战后首次由统一的德国参与的德甲冠军被斯图加特夺得，它在最后一轮中力压法兰克福和多特蒙德而登顶 。
这一时期德甲各队的竞争实力较往年更为均衡，10年 *** 有5支球队夺得冠军 。
多特蒙德凭借大手笔投入将尤尔根·科勒尔、斯特凡·罗伊特和安德烈亚斯·穆勒等欧洲杯冠军队成员从海外招致麾下，从而成为拜仁慕尼黑的主要竞争对手之一 。
除了斯图加特和云达不来梅，凯泽斯劳滕也在1998年夺得德甲冠军，成为第一支及唯一一支从德乙升级后直接夺冠的球队 。
在1990年代，德甲球队同样每年至少有1支球队入围欧洲赛事的半决赛，其中1次获得欧洲冠军联赛冠军（多特蒙德于1997年）、2次获得欧洲联盟杯冠军（拜仁慕尼黑于1996年和沙尔克04于1997年）以及1次获得欧洲优胜者杯（云达不来梅于1992年） 。
卡尔斯鲁厄、弗赖堡和沃尔夫斯堡等一些新崛起的球队在其首个德甲赛季中便获得了欧洲联盟杯的参赛资格，卡尔斯鲁厄甚至在1994年进入了欧洲联盟杯半决赛 。
而长时间位于德甲的一些传统强队例如法兰克福、门兴格拉德巴赫和凯泽斯劳滕则在这一时期先后经历了首次降级 。
自2000年以来，拜仁慕尼黑共获得了7次德甲冠军 。
期间也获得过冠军的其它球队包括多特蒙德（2002年、2011年和2012年）、云达不来梅（2004年）、斯图加特（2007年）以及在2009年首次夺冠的沃尔夫斯堡 。
这一时期的德甲冠军往往要到最后一轮才决出 。
1999-00赛季中，拜耳勒沃库森只需在最后一轮战平翁特哈兴便可夺冠，但0:2的失利使其只能将冠军拱手相让给拜仁慕尼黑 。
更为戏剧化的冠军争夺发生在随后一个赛季，沙尔克04在其最后一轮的比赛结束后错误认为已加冕德甲冠军，但拜仁慕尼黑凭借其补时阶段的进球成功捍卫了自己的冠军头衔 。
沙尔克04也因此被其球迷称作“心中的冠军（Meister der Herzen）” 。
2003年8月24日，有“德甲恐龙”之称的汉堡在主场对阵“纪录冠军”，就此揭开了德甲联赛第40年的序幕 。
同年，德甲开始为冠军球队设立冠军星章 。
2005年1月，由足球裁判罗伯特·霍伊泽尔参与的赌球丑闻震惊了德国 。
然而，受到牵连的赛事仅在德乙联赛、德国足协杯和地区联赛之中 。
德国足协及德国足球职业联盟随即在丑闻过后设置了一个早期预警系统，用以监测未来不寻常的投注 。
尽管如此，德甲的观众总人数纪录还是在不断刷新 。
2004-05赛季的306场比赛共吸引了超过1156万名观众到场观战（平均每场37,781人），这一数字为欧洲五大联赛最高 。
多特蒙德主场的平均上座率也为欧洲各队之冠，达到场均77,235人 。
造成观众人数不断攀升的原因是德国为承办2006年世界杯而改造及新建了许多现代化的体育场，体育场还根据不同的观众需求增加了商务包厢；以及民众对足球的兴趣普遍提高，当中女观众的数量也占了相当的比重 。
跨入新千年后，德甲球队随即连续2次进入欧洲冠军联赛决赛（拜仁慕尼黑于2001年和勒沃库森于2002年）及1次进入欧洲联盟杯决赛（多特蒙德于2002年） 。
拜仁慕尼黑在2001年获得的欧冠奖杯是德甲球队于2000年代唯一一次在欧洲赛场上夺冠 。
2009年，云达不来梅与汉堡在欧洲联盟杯半决赛中相遇，前者获得了胜利并成为自2002年以来第一支进入欧洲赛事决赛的德甲球队 。
但在决赛中，云达不来梅战至加时赛终以1:2不敌顿涅茨克矿工 。
进入2010年代后，拜仁慕尼黑曾分别在2010年及2012年进入欧洲冠军联赛决赛，但均无缘冠军 。
然而至2012-13赛季，多特蒙德及拜仁慕尼黑成功会师欧冠决赛，由后者时隔12年再度加冕欧洲冠军 。
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