琼脂糖凝胶电泳,琼脂糖凝胶电泳检测DNA

大家好,关于琼脂糖凝胶电泳很多朋友都还不太明白,不知道是什么意思,那么今天我就来为大家分享一下关于琼脂糖凝胶电泳检测DNA的相关知识,文章篇幅可能较长,还望大家耐心阅读,希望本篇文章对各位有所帮助!
1琼脂糖凝胶电泳的原理是什么?原理如下:
琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳 ***。其分析原理与其他支持物电泳最主要区别是:它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用 。
琼脂糖凝胶具有 *** 结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这就大大提高了分辨能力 。
但由于其孔径相比于蛋白质太大,对大多数蛋白质来说其分子筛效应微不足道,现广泛应用于核酸的研究中 。
目前多用琼脂糖为电泳支持物进行平板电泳,其优点如下:
(1)琼脂糖凝胶电泳操作简单,电泳速度快,样品不需事先处理就可以进行电泳 。
(2)琼脂糖凝胶结构均匀,含水量大(约占98%~99%),近似自由电泳,样品扩散较自由电流,对样品吸附极微,因此电泳图谱清晰,分辨率高,重复性好 。
(3)琼脂糖透明无紫外吸收,电泳过程和结果可直接用紫外光灯检测及定量测定 。
(4)电泳后区带易染色,样品极易洗脱,便于定量测定 。制成干膜可长期保存 。
以上内容参考:百度百科-琼脂糖凝胶电泳
2琼脂糖凝胶电泳的原理什么琼脂糖凝胶电泳的原理:琼脂糖凝胶电泳是常用的用于分离、鉴定DNA、RNA分子混合物的 *** ,这种电泳 *** 以琼脂凝胶作为支持物,利用DNA分子在泳动时的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合物的目的 。
DNA分子在高于其等电点的溶液中带负电,在电场中向阳极移动 。在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即分子本身的大小和构型是主要的影响因素 。DNA分子的迁移速度与其相对分子量成反比 。
不同构型的DNA分子的迁移速度不同 。如环形DNA分子样品,其中有三种构型的分子:共价闭合环状的超螺旋分子(cccDNA)、开环分子(ocDNA)、和线形DNA分子(IDNA) 。这三种不同构型分子进行电泳时的迁移速度大小顺序为:cccDNA>IDNA>ocDNA
核酸分子是两性解离分子,pH3.5是碱基上的氨基解离,而三个磷酸基团中只有一个磷酸解离,所以分子带正电,在电场中向负极泳动;而?pH8.0-8.3时,碱基几乎不解离,而磷酸基团解离,所以核酸分子带负电,在电场中向正极泳动 。
不同的核酸分子的电荷密度大致相同,因此对泳动速度影响不大 。在中性或碱性时,单链DNA与等长的双链DNA的泳动率大致相同 。
扩展资料
影响核酸分子泳动率的因素
1、样品的物理性状
即分子的大小、电荷数、颗粒形状和空间构型 。一般而言,电荷密度愈大,泳动率越大 。但是不同核酸分子的电荷密度大致相同,所以对泳动率的影响不明显 。
对线形分子来说,分子量的常用对数与泳动率成反比,用此标准样品电泳并测定其泳动率,然后进行DNA分子长度(bp)的负对数——泳动距离作标准曲线图,可以用于测定未知分子的长度大小 。
DNA分子的空间构型对泳动率的影响很大,比如质粒分子,泳动率的大小顺序为:cDNA>IDNA>ocDNA但是由于琼脂糖浓度、电场强度、离子强度和溴化乙锭等的影响,会出现相反的情况 。
2、支持物介质
核酸电泳通常使用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶两种介质,琼脂糖是一种聚合链线性分子 。含有不同浓度的琼脂糖的凝胶构成的分子筛的网孔大小不同,是于分离不同浓度范围的核酸分子 。聚丙烯酰胺凝胶由丙烯酰胺(Acr)在N,N,N′-四甲基乙四胺(TEMED)和过 *** 铵(AP)的催化下聚合形成长链,并通过交联剂N,N′-亚甲双丙烯酰胺(Bis)交叉连接而成,其网孔的大小由Acr与Bis的相对比例决定 。
琼脂糖凝胶适合分离长度100至60的分子,而聚丙烯酰胺凝胶对于小片段(5bp-500bp)的分离效果更好 。选择不同浓度的凝胶,可以分离不同大小范围的DNA分子 。
3、电场强度
电场强度愈大,带点颗粒的泳动越快 。但凝胶的有效分离范围随着电压增大而减小,所以电泳时一般采用低电压,不超过4V/cm 。而对于大片段电泳,甚至用0.5-1.0V/cm电泳过夜 。进行高压电泳时,只能使用聚丙烯酰胺凝胶 。
4、缓冲液离子强度
核酸电泳常采用TAE、?TBE、TPE三种缓冲系统,但它们各有利弊 。TAE价格低廉,但缓冲能力低,必须进行两极缓冲液的循环 。TPE在进行DNA回收时,会使DNA污染磷酸盐,影响后续反应 。所以多采用TBE缓冲液 。

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