无论厂卫权力消长如何，但二者同是特务机关，同由一个人（皇帝自已或是司礼太监)领导指挥，虽然偶或也互相内斗，一般说来，彼此还是勾结得很密切，相依相辅，狼狈为奸 。
这里，就必须提到特务的最高指挥机关司礼监了 。
如前所述，东厂在明代后半期是规定必须“专用司礼秉笔第二人或第三人为之”，这就是说司礼监和东厂是一体的，监既能得之于内，厂又能得之于外，集行政立法司法三权于一，势力之大，实是莫与伦比了 。
监与厂既二位一体，握有这样最高的实权，那么，对于一个不是由宦官主持的特务机关锦衣卫，他们自然也要抓在手中，进一步造成三位一体 。于是他们便派自己的族戚私人来充任卫使 。如朱厚照初年锦衣卫使高得林便是司礼太监高凤的侄子 。
后来司礼太监刘瑾得势，东厂提督邱聚，西厂提督谷大用，锦衣卫使石文义，都是他的私人 。魏忠贤自理厂事，就派田尔耕任卫使，都是极明显的例子 。
司礼监、东厂、锦衣卫三者既成一体，监与厂不可分，已如上述，而厂与卫不可分，实证就更多 。
比如上面说的，在卫的方面，高级人员如卫使多半是宦官私人，而在厂的方面，底下所有的番役，都是从卫里挑选来的 。因为关系如此密切，所以，有些任务就是由厂卫共同执行 。
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如像“纠仪”就是 。明制，凡是朝会的时候，厂卫率领所属及校尉五百名，列侍奉天门下纠仪 。如果有人失仪，就立刻褫脱衣冠，抓下镇抚司狱，痛打一顿，再送回来 。
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