1234年，在蒙古人的有力打击下，盛极一时的金国土崩瓦解 。先前徙居中原、华北和辽东的女真族迅速被同化 。而那些留居在故地的女真族，一夜之间作鸟兽散，重又分散为众多的部落，接受来自元朝新政权的统治 。
在元代，松花江和黑龙江下游，称之为混同江，元朝在这里设立桃温、胡里改、斡朵怜、脱斡邻、荸苦江5个万户府；又在黑龙江口特林地方设东征元帅府，在乌苏里江流域设阿速古千户所，在滨海地区设鲸海千户所，在黑龙江下游设兀者野人、乞列迷万户府 。一般情况是，万户府下有千户所，千户所下又有百户所 。这些女真部落，“各仍旧俗，无市并城郭，逐水草为居，以射猎为业” 。
永乐元年(1403)，明朝皇帝朱棣派人到黑龙江、乌苏里江流域招抚女真族 。女真，原作“朱里真”，又作“朱里扯特”、“主儿彻惕”、“主儿扯惕”、“拙尔察歹”，满语称之为“珠申”、“诸申” 。
明朝女真族的分化和重组
明朝先后设辽东都司25卫，奴儿干部司384卫，统辖整个东北地区 。女真族分布在松花江以东，黑龙江下游以西，濒临日本海，南界朝鲜半岛的广大地区 。明初，依照分布区域，把女真族划作三大集团，建州女真、海西女真和野人女真 。
建州女真，以原渤海国建州为部名，分布在长白山、牡丹江、绥芬河之间，以今吉林珲春县、黑龙江宁安县为聚居地 。
建州女真，原为居住在黑龙江三姓(今依兰)的火儿阿部 。明初，火儿阿部酋长阿哈出，赐名李思诚，任建州卫指挥 。永乐八年（1410)，阿哈出死后，他的儿子释家奴，赐名李显忠，世袭父职 。宣德年间，阿哈出之孙李满住，率部从三姓迁至宁古塔，又迁至婆猪江(今浑江)一带 。正统初，因受海西女真、朝鲜的侵扰，又迁到苏子河上游的灶突山(今辽宁新宾县呼兰哈达)附近 。建州女真另一支，为居住在三姓附近的斡朵里部，酋长为猛哥帖木耳(孟特穆)，永乐八年，因野人女真侵扰而南迁，几经转迁，于正统初重新集结于浑河流域 。
正统七年(1442)，明朝设建州左卫、建州右卫，与建州卫合称“建州三卫” 。万历年间，明朝先后封努尔哈赤为都督佥事、龙虎将军 。1583—1593年，努尔哈赤起兵后11年，以赫图阿拉(今辽宁新宾)为中心，逐渐统一了女真各部 。1599—1616年，又相继统一扈伦四部 。1616年，努尔哈赤称汗，国号“大金”，以赫图阿拉为兴京，史称后金 。
海西女真，沿用元代地名，因居地在东海之西而得名，分布在松花江下游的吉林扶余县至黑龙江阿城县一带 。
海西之名，始见于元代，泛指海西诸卫的女真人 。海西女真有哈达、辉发、乌拉、叶赫四部，又有山夷、江夷之分 。山夷依山作窟，即熟女真完颜种；江夷居黑龙江，即生女真 。哈达、叶赫属山夷，而辉发、乌拉则属江夷 。后迁至呼兰河流域，呼兰与呼伦(扈伦)为音转，又称呼伦四部 。17世纪初，为努尔哈赤所吞并 。
野人女真，同样是沿袭元代旧名，是女真中比较落后的一部分，故冠以“野人”之称，分布在黑龙江中下游两岸及乌苏里江以东 。
野人女真，又称东海女真、东海窝集部，分为萨哈连、呼尔哈、瓦尔喀、库尔喀四部 。而呼尔哈部，是建州女真的老家所在 。后来，留居原地的仍为呼尔哈部，而迁走的就是建州女真 。
明代女真族是重新组合的民族 。建州卫、毛怜卫的女真族，多是渤海族遗民，从事农耕定居生活，种谷纺线，饮食服用，与汉族没有多大区别 。海西女真人，多是金代完颜部后裔，同样也从事耕稼，他们倚山作寨，亲属聚居在一起 。野人女真，又称女真野人，是女真族同赫哲族、鄂伦春族融合而成的一支，风俗与海西女真相同，所不同的是，“不事耕稼，惟以捕猎为生” 。
满族始称满洲，后有新(满语“伊彻”)旧(满语“弗”)满洲之分，实际上包含东北几乎所有的少数民族 。
正统七年(1442)，建州卫、建州左卫、建州右卫，在明朝统治下形成一个强大的部落 。“建州三卫”的出现，标志了满族主体部分的形成 。在女真族的旗帜下，不止是女真各部，还有赫哲族、鄂伦春族、锡伯族的先民们，也采用了女真族的名号 。15—17世纪，满族已成为一个新的共同体 。所以，满洲之为族称，是以建州、海西女真为主体，同时又包括了大部分野人女真，当地的汉族、蒙古族和别的民族，也是构成满族的重要因素 。
肃慎作为满族的最早先民，尽管史书上语焉不详，但考古发掘资料却提供了有说服力的物证 。肃慎及其后裔，既有关联又不能等同，不应该把肃慎以下的邑娄、勿吉、靺鞨、女真各族的形成发展过程，当为满族本身的形成发展过程 。可又不能把肃慎以下，直至明代女真人的世代相承关系，与满族的形成割裂开来 。满族真正以一个民族出现，只能说在明代末期的17世纪之初，这时已从女真人中间形成了一个新的民族共同体 。满族的历史，起源于明代女真的分化和重新组合 。
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