此外 ， 该书除保持《嘉祐本草》体例外 ， 还创用墨盖子作为唐氏新增内容的标记 。在具体写法上 ， 该书继续延用《新修本草》以降诸本草书的方法 ， 即正文用单行大字 ， 注文用双行小字；正文中系《神农本草经》者用黑底白字 ， 系《名医别录》者用黑体大字 ， 系《新修本草》者冠以“唐本先附” ， 系《开宝本草》者标以“今附” ， 系《嘉祐本草》者以“新补”或“新定”标引；注文中属《本草经集注》者冠以“陶隐居” ， 属《新修本草》者指出“唐本注” ， 属《开宝本草》者用“今按”或“今注”引出 ， 属《嘉祐本草》者以“臣掌禹锡谨案”作注 。
书中凡唐慎微本人新增的内容以墨盖子作为标志 ， 有时也用文字说明 ， 使人一目了然 。《证类本草》对《嘉祐本草》、《本草图经》、唐氏新增三方面内容亦作了妥善安排 ， 书中药后的药图及“图经曰”以下的小字为《本草图经》内容；夹在药图与“图经曰”之间的正文或注文 ， 均为《嘉祐本草》的内容；凡墨盖子以下的内容 ， 均为唐慎微新增 。唐氏引文均以大字标明出处 ， 小字接书其文 ， 层次非常分明 。《日本访书志补》评价说：“此书集本草之大成 ， 最足依据 ， 且墨箧墨盖 ， 黑字白字 ， 使神农本经、隐居别录、苏敬新修皆可识别 。其体例亦最为严谨 。”此评价是非常恰当的 。
唐慎微在《证类本草》中 ， 不仅合并了宋代掌禹锡的《嘉祐本草》和苏颂著的《图经本草》的全部内容 ， 而且旁征博引 ， 精细考察 ， 采用图文对照形式 ， 辑录了宋以前各家医药著作 ， 从而为后世保存了大量的医药文献 。《神农本草经》《本经集注》《新修本草》《炮炙论》《开宝本草》《海药本草》等已散失的珍贵本草文献的主要内容 ， 都依靠《证类本草》得以保存下来 ， 利于后世辑复 。
唐慎微以自己的智慧克服了收集资料不易的困难 ， 他用毕生心血凝成的《证类本草》一书 ， 在本草发展的历程中树起一块丰碑 ， 也圆了他自己的一个梦 。
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